Компьютерный анализ биологической модели стационарных сообществ: различия между версиями

Материал из Wiki - Факультет компьютерных наук
Перейти к навигации Перейти к поиску
Новая страница: «{{Карточка_проекта |name=Компьютерный анализ биологической модели стационарных сообществ…»
 
Нет описания правки
 
Строка 8: Строка 8:
|categorize=yes
|categorize=yes
}}
}}
===Что это за проект? ===
Проект разрабатывается при взаимодействии с научной группой немецкого учёного Ульфа Дикмана (институт IIASA, Laxenburg, Austria)
http://www.iiasa.ac.at/web/home/research/researchPrograms/EvolutionandEcology/New-page.en.html
Требуется разработать программный комплекс, проводящий численное моделирование системы, зависящее от входных параметров (параметры смертности, конкурентности, движения). По результатам проведённых экспериментов -- построить ряд двумерных и трёхмерных графиков. На входе: параметры биологической модели. На выходе: массив данных, по которым требуется построить графики.
Еще одной задачей могло бы стать разработка стабильных компьютерных симуляций изучаемой биологической модели, и сравнение результатов этой симуляции с результатами численного метода.
===Чему вы научитесь? ===
Студент ознакомится с методами математической биологии, численными методами решения интегральных уравнений, языку программирования Matlab, работе с суперкомпьютерными вычислениями (у нашей научной группы есть доступ к суперкомпьютеру "Ломоносов").
Кроме того, студент сможет улучшить свой английский язык, изучая литературу, изданную в зарубежных изданиях, и общаясь с австрийскими коллегами.
===Какие начальные требования? ===
знание английского языка и языка программирования C/C++ хотя бы на начальном уровне. Но в первую очередь будет важна инициатива и желание изучать разные новые вещи. 
===Какие будут использоваться технологии? ===
алгоритмы системы Matlab, ГРИД, OpenMP
===Темы вводных занятий ===
модель Ульфа Дикамна, одновидовые и двухвидовые модели стационарных сообществ, случайные процессы.
===Направления развития ===
распараллеливание алгоритмов для эффективного вычисления на суперкомпьютере.
===Критерии оценки ===
Будет объявлено позже
===Ориентировочное расписание занятий ===
* ПН с 15:00 
* ВТ по предварительной договорённости
* СР недоступен
* ЧТ с 13:40
* ПТ по предварительной договорённости
* СБ 12:10 - 14:00
===Контакты===
Алексей Никитин nikitin@cs.msu.su

Текущая версия от 09:01, 16 октября 2018

Ментор Алексей Никитин
Учебный семестр Осень 2018
Учебный курс 2-й курс
Максимальное количество студентов, выбравших проект: 2



Что это за проект?

Проект разрабатывается при взаимодействии с научной группой немецкого учёного Ульфа Дикмана (институт IIASA, Laxenburg, Austria)

http://www.iiasa.ac.at/web/home/research/researchPrograms/EvolutionandEcology/New-page.en.html

Требуется разработать программный комплекс, проводящий численное моделирование системы, зависящее от входных параметров (параметры смертности, конкурентности, движения). По результатам проведённых экспериментов -- построить ряд двумерных и трёхмерных графиков. На входе: параметры биологической модели. На выходе: массив данных, по которым требуется построить графики.

Еще одной задачей могло бы стать разработка стабильных компьютерных симуляций изучаемой биологической модели, и сравнение результатов этой симуляции с результатами численного метода.


Чему вы научитесь?

Студент ознакомится с методами математической биологии, численными методами решения интегральных уравнений, языку программирования Matlab, работе с суперкомпьютерными вычислениями (у нашей научной группы есть доступ к суперкомпьютеру "Ломоносов").

Кроме того, студент сможет улучшить свой английский язык, изучая литературу, изданную в зарубежных изданиях, и общаясь с австрийскими коллегами.

Какие начальные требования?

знание английского языка и языка программирования C/C++ хотя бы на начальном уровне. Но в первую очередь будет важна инициатива и желание изучать разные новые вещи.

Какие будут использоваться технологии?

алгоритмы системы Matlab, ГРИД, OpenMP

Темы вводных занятий

модель Ульфа Дикамна, одновидовые и двухвидовые модели стационарных сообществ, случайные процессы.

Направления развития

распараллеливание алгоритмов для эффективного вычисления на суперкомпьютере.

Критерии оценки

Будет объявлено позже

Ориентировочное расписание занятий

  • ПН с 15:00
  • ВТ по предварительной договорённости
  • СР недоступен
  • ЧТ с 13:40
  • ПТ по предварительной договорённости
  • СБ 12:10 - 14:00

Контакты

Алексей Никитин nikitin@cs.msu.su

Источник — https://wiki.cs.hse.ru/index.php?title=Компьютерный_анализ_биологической_модели_стационарных_сообществ&oldid=30123