Майнор Биоинформатика 2 год 2022/23: различия между версиями

Материал из Wiki - Факультет компьютерных наук
Перейти к навигации Перейти к поиску
← Предыдущая правкаСледующая правка →
Строка 45: Строка 45:
'''ДЗ1''' Сборка генома (Дмитрий Меньщиков) --
'''ДЗ1''' Сборка генома (Дмитрий Меньщиков) --
[https://youtu.be/mww_FcvkScI видео],
[https://youtu.be/mww_FcvkScI видео],
[https://docs.google.com/document/d/1vpFZF5F82_xjZPXGcm-ADsh4yhiWc_sUirHaFtQGNDA/edit Инструкция]
[https://docs.google.com/document/d/1vpFZF5F82_xjZPXGcm-ADsh4yhiWc_sUirHaFtQGNDA/edit задание]
|-
|-
| 4
| 4
Строка 68: Строка 68:
[https://youtu.be/YKtfkmwdfJQ видео],
[https://youtu.be/YKtfkmwdfJQ видео],
[https://colab.research.google.com/drive/12XnH8WmwZ8gz4o4rDLNrJB0XuIAL72Hr?usp=sharing тетрадка],
[https://colab.research.google.com/drive/12XnH8WmwZ8gz4o4rDLNrJB0XuIAL72Hr?usp=sharing тетрадка],
[https://docs.google.com/document/d/1hDFQYynGaRw43X5QlyPbMek5DDHvKFvzIJZJfSZnjWk/edit инструкция]
[https://docs.google.com/document/d/1hDFQYynGaRw43X5QlyPbMek5DDHvKFvzIJZJfSZnjWk/edit задание]
|-
|-
| 6
| 6
Строка 90: Строка 90:
'''ДЗ3'''  ''Ab initio'' предсказание генов (Дмитрий Бушнев) --  
'''ДЗ3'''  ''Ab initio'' предсказание генов (Дмитрий Бушнев) --  
[https://youtu.be/U5WuigrZvr8 видео],
[https://youtu.be/U5WuigrZvr8 видео],
[https://colab.research.google.com/drive/1bJnuCnWStcupKug_l1N9yaVxfmqtIORn?usp=sharing тетрадка]
[https://colab.research.google.com/drive/1bJnuCnWStcupKug_l1N9yaVxfmqtIORn?usp=sharing тетрадка],
[https://docs.google.com/document/d/1Z7og5KC2rNgTxrsglcwNWdsqMuPLZnIyQbPZX-VkEts/edit?usp=sharing задание]
|-
|-
|  
|  

Версия от 17:57, 25 октября 2022

Телеграм группа курса

Модули 1 и 2 - Анализ данных секвенирования

Формула расчет оценки

Накоп = Округление( (ДЗ1+ДЗ2+ДЗ3+ДЗ4+ДЗ5+ДЗ6)/6 )
Если Накоп >=6, то студент может получить Накоп в качестве итоговой оценки, не приходя на экзамен.
В случае сдачи экзамена к оценке Накоп добавляется 0.3*Э. Экзамен письменный, оценивается по 10-бальной шкале

Лекции и семинары

Записи всех лекций и семинаров

# Дата Лекция (11:10 - 12:30) Семинар (12:40 - 14:00)
1 08.09

Введение в молекулярную биологию -- видео, слайды

Создание аккаунтов на серверах -- Инструкция 1, Инструкция 2, Таблица

2 15.09

Методы секвенирования ДНК -- видео, слайды

Введение в github и Google colab
3 22.09

Сборка генома (Артем Касьянов) -- видео, слайды

ДЗ1 Сборка генома (Дмитрий Меньщиков) -- видео, задание

4 29.09

Алгоритмы предсказания генов -- видео, слайды

Разбор домашнего задания 1 -- видео, слайды

5 06.10

Аннотация функций генов -- видео, слайды

ДЗ2 Аннотация генома (Иван Геворков) -- видео, тетрадка, задание

6 13.10

Сдвиг рамки считывания -- видео, слайды

Подготовка к домашнему заданию 3 (Егор Фурсов) -- видео, тетрадка

7 20.10

Генная инженерия (Анатолий Зубрицкий) -- видео, слайды

ДЗ3 Ab initio предсказание генов (Дмитрий Бушнев) -- видео, тетрадка, задание

27.10 Сессия
8 03.11

Геном человека и некодирующие РНК -- 2021_fall_day08

Повторы в геноме человека (Дмитрий Коновалов?) -- 2021_fall_day09

9 10.11 Введение в РНК-сек ДЗ4 РНК-сек (Дмитрий Бушнев)
10 17.11 Экспериментальные аспекты секвенирования ДНК (Анатолий Зубрицкий)?
11 24.11 Секвенирование отдельных клеток ДЗ5 single cell РНК-сек (Егор Фурсов)
12 01.12 - Создание файла .vcf?
13 08.12 GWAS и популяционная генетика ДЗ6 Создание генетического паспорта?
14 15.12 Древняя ДНК -
15 22.12

Развитие жизни на Земле -- 2021_fall_day06

Ответы на вопросы по оценкам за ДЗ?
16 29.12 Экзамен -
Источник — https://wiki.cs.hse.ru/index.php?title=Майнор_Биоинформатика_2_год_2022/23&oldid=73551