Майнор Биоинформатика 2 год 2022/23: различия между версиями

Материал из Wiki - Факультет компьютерных наук
Перейти к навигации Перейти к поиску
← Предыдущая правкаСледующая правка →
Строка 101: Строка 101:
||
||
Геном человека и некодирующие РНК --
Геном человека и некодирующие РНК --
[https://youtu.be/w9osm8OXQaA видео],
[https://drive.google.com/file/d/1o62kgUXVHPxrOh0DDcmH-RJaq11tIhpD/view?usp=sharing слайды]
[https://drive.google.com/file/d/1o62kgUXVHPxrOh0DDcmH-RJaq11tIhpD/view?usp=sharing слайды]
||
||
Повторы в геноме человека (Дмитрий Коновалов) --
Повторы в геноме человека (Дмитрий Коновалов) --
[https://youtu.be/oQmClx83BNQ видео],
[https://colab.research.google.com/drive/1ACHzlef1u9vidHHocV87cFPMFw-Pke_N?usp=sharing тетрадка]
[https://colab.research.google.com/drive/1ACHzlef1u9vidHHocV87cFPMFw-Pke_N?usp=sharing тетрадка]
|-
|-
Строка 109: Строка 111:
|| 10.11
|| 10.11
||
||
Введение в РНК-сек (Анатолий Зубрицкий)
Введение в РНК-сек (Анатолий Зубрицкий) --
[https://youtu.be/wo7MC1MSt8o видео]
||
||
'''ДЗ4''' РНК-сек (Дмитрий Бушнев) --
'''ДЗ4''' РНК-сек (Дмитрий Бушнев) --
[https://youtu.be/ATaTRS4ldY0 видео],
'''[https://docs.google.com/document/d/1em3ictlXzfacZqaG5Rn5i3QAnvNlT-eKPP4yV24_8M4/edit?usp=sharing задание]'''
'''[https://docs.google.com/document/d/1em3ictlXzfacZqaG5Rn5i3QAnvNlT-eKPP4yV24_8M4/edit?usp=sharing задание]'''
|-
|-

Версия от 01:39, 11 ноября 2022

Телеграм группа курса

Модули 1 и 2 - Анализ данных секвенирования

Формула расчет оценки

Накоп = Округление( (ДЗ1+ДЗ2+ДЗ3+ДЗ4+ДЗ5+ДЗ6)/6 )
Если Накоп >=6, то студент может получить Накоп в качестве итоговой оценки, не приходя на экзамен.
В случае сдачи экзамена к оценке Накоп добавляется 0.3*Э. Экзамен письменный, оценивается по 10-бальной шкале

Лекции и семинары

Записи всех лекций и семинаров

# Дата Лекция (11:10 - 12:30) Семинар (12:40 - 14:00)
1 08.09

Введение в молекулярную биологию -- видео, слайды

Создание аккаунтов на серверах -- Инструкция 1, Инструкция 2, Таблица

2 15.09

Методы секвенирования ДНК -- видео, слайды

Введение в github и Google colab
3 22.09

Сборка генома (Артем Касьянов) -- видео, слайды

ДЗ1 Сборка генома (Дмитрий Меньщиков) -- видео, задание

4 29.09

Алгоритмы предсказания генов -- видео, слайды

Разбор домашнего задания 1 -- видео, слайды

5 06.10

Аннотация функций генов -- видео, слайды

ДЗ2 Аннотация генома (Иван Геворков) -- видео, тетрадка, задание

6 13.10

Сдвиг рамки считывания -- видео, слайды

Подготовка к домашнему заданию 3 (Егор Фурсов) -- видео, тетрадка

7 20.10

Генная инженерия (Анатолий Зубрицкий) -- видео, слайды

ДЗ3 Предсказание генов (Дмитрий Бушнев) -- видео, тетрадка, задание

27.10 Сессия
8 03.11

Геном человека и некодирующие РНК -- видео, слайды

Повторы в геноме человека (Дмитрий Коновалов) -- видео, тетрадка

9 10.11

Введение в РНК-сек (Анатолий Зубрицкий) -- видео

ДЗ4 РНК-сек (Дмитрий Бушнев) -- видео, задание

10 17.11 Экспериментальные аспекты секвенирования ДНК (Анатолий Зубрицкий)
11 24.11 Секвенирование отдельных клеток ДЗ5 single cell РНК-сек (Егор Фурсов)
12 01.12 - Создание файла .vcf?
13 08.12 GWAS и популяционная генетика ДЗ6 Создание генетического паспорта?
14 15.12 Древняя ДНК -
15 22.12

Развитие жизни на Земле -- 2021_fall_day06

Ответы на вопросы по оценкам за ДЗ?
16 29.12 Экзамен -
Источник — https://wiki.cs.hse.ru/index.php?title=Майнор_Биоинформатика_2_год_2022/23&oldid=73991