Майнор Биоинформатика 2 год 2024/25: различия между версиями
Перейти к навигации
Перейти к поиску
| Строка 34: | Строка 34: | ||
|| 26.09 | || 26.09 | ||
|| | || | ||
Алгоритмы предсказания генов | Алгоритмы предсказания генов [https://docs.google.com/presentation/d/1evCi5vem8cybj-m3IyEUY1LEqjvt_m2G/edit?usp=sharing&ouid=109540323021403462314&rtpof=true&sd=true слайды] | ||
|| | || | ||
| Строка 40: | Строка 40: | ||
|- | |- | ||
| 5 | | 5 | ||
|| | || 03.10 | ||
|| | || | ||
Аннотация функций генов | Аннотация функций генов [https://docs.google.com/presentation/d/1Ct7lvWRWiPuKaRBDKtxHM5E4sXEN-LGN/edit?usp=sharing&ouid=109540323021403462314&rtpof=true&sd=true слайды] | ||
|| | || | ||
'''ДЗ2''' Аннотация генома | '''ДЗ2''' Аннотация генома | ||
|- | |- | ||
| 6 | | 6 | ||
|| | || 10.10 | ||
|| | || | ||
Сдвиг рамки считывания | Сдвиг рамки считывания | ||
Версия от 07:14, 10 октября 2024
Модули 1 и 2 - Анализ данных секвенирования
Формула расчет оценки
Накоп = Округление( Среднее(ДЗ1+ДЗ2+ДЗ3+ДЗ4+ДЗ5+квиз)*0.8 ) Студент имеет право зачесть Накоп в качестве итоговой оценки, не приходя на экзамен. В случае сдачи экзамена к оценке Накоп добавляется 0.3*Э. Экзамен письменный, оценивается по 10-бальной шкале
Лекции и семинары
| # | Дата | Лекция (11:10 - 12:30) | Семинар (12:40 - 14:00) |
|---|---|---|---|
| 1 | 05.09 |
Введение в молекулярную биологию лекция |
Создание аккаунтов на серверах инструкция |
| 2 | 12.09 |
Методы секвенирования ДНК лекция |
Введение в github и Google colab. Sra toolkit тетрадка |
| 3 | 19.09 |
Сборка генома слайды |
ДЗ1 Сборка генома текст |
| 4 | 26.09 |
Алгоритмы предсказания генов слайды |
Алгоритмы предсказания генов. Практика |
| 5 | 03.10 |
Аннотация функций генов слайды |
ДЗ2 Аннотация генома |
| 6 | 10.10 |
Сдвиг рамки считывания |
Семинар |
| 7 | 24.10 |
Геном человека и некодирующие РНК |
ДЗ3 Предсказание генов |
| Сессия | |||
| 8 | 31.10 |
Введение в РНК-сек |
ДЗ4 РНК-сек |
| 9 | 07.11 |
Анализ данных РНК-сек |
Анализ данных РНК-сек |
| 11 | 14.11 |
Секвенирование отдельных клеток [ |
ДЗ5 single cell РНК-сек |
| 12 | 21.11 | Проверочная работа по теме РНК-сек | Разбор ДЗ5 single cell РНК-сек |
| 13 | 28.11 | GWAS | GWAS |
| 14 | 05.12 | Метагеномика. Лекция | Семинар |
| 15 | 12.12 | Заключение | Заключение. Дописывание квиза. |
| 16 | 19.12 | Экзамен | |