Майнор Биоинформатика 2 год 2025/26: различия между версиями
Перейти к навигации
Перейти к поиску
| Строка 56: | Строка 56: | ||
|| 16.10 | || 16.10 | ||
|| | || | ||
Некодирующие РНК [https://docs.google.com/presentation/d/1yQgQUQm-kwYxZLXSIPgoiHlNZWUjsupa/edit?usp=sharing&ouid=109540323021403462314&rtpof=true&sd=true слайды] | |||
|| | || | ||
Infernal, tRNAscan | Infernal, tRNAscan | ||
| Строка 63: | Строка 63: | ||
|| 23.10 | || 23.10 | ||
|| | || | ||
Введение в РНК-сек | Введение в РНК-сек [https://docs.google.com/presentation/d/1tr4eRUYeDdx5c0KGoJDsQBxW02MSoM4f/edit?usp=sharing&ouid=109540323021403462314&rtpof=true&sd=true слайды] | ||
|| | || | ||
Семинар о РНК-сек | Семинар о РНК-сек | ||
| Строка 70: | Строка 70: | ||
|| 06.11 | || 06.11 | ||
|| | || | ||
Анализ данных РНК-сек | Анализ данных РНК-сек [https://docs.google.com/presentation/d/1nIqsc4JEgUNm5cNplqLiVGMcdwhBLFGE/edit?usp=sharing&ouid=109540323021403462314&rtpof=true&sd=true слайды] | ||
|| | || | ||
'''ДЗ3''' РНК-сек | '''ДЗ3''' РНК-сек | ||
|- | |- | ||
Версия от 13:44, 10 ноября 2025
Модули 1 и 2 - Анализ данных секвенирования
Формула расчет оценки
Накоп = Округление( Среднее(ДЗ1+ДЗ2+ДЗ3+ДЗ4+ДЗ5+квиз)*0.7 ) Студент имеет право зачесть Накоп в качестве итоговой оценки, не приходя на экзамен. В случае сдачи экзамена к оценке Накоп добавляется 0.3*Э. Экзамен письменный, оценивается по 10-бальной шкале
Лекции и семинары
| # | Дата | Лекция (11:10 - 12:30) | Семинар (12:40 - 14:00) |
|---|---|---|---|
| 1 | 04.09 |
Введение в молекулярную биологию лекция |
Создание аккаунтов на серверах инструкция |
| 2 | 11.09 |
Методы секвенирования ДНК лекция |
Введение в github и Google colab. Sra toolkit тетрадка |
| 3 | 18.09 |
Сборка генома слайды |
FastQC, MultiQC, cборка генома |
| 4 | 26.09 |
Алгоритмы предсказания генов слайды |
Алгоритмы предсказания генов. Практика |
| 5 | 03.10 |
Аннотация функций генов. Домены. слайды |
InterPro. PFam. HMMER. |
| 6 | 9.10 |
Сдвиг рамки считывания |
Семинар |
| 7 | 16.10 |
Некодирующие РНК слайды |
Infernal, tRNAscan |
| 8 | 23.10 |
Введение в РНК-сек слайды |
Семинар о РНК-сек |
| 9 | 06.11 |
Анализ данных РНК-сек слайды |
ДЗ3 РНК-сек |